Wadium

Wadium w 2 minuty

Uzyskaj wadium bez dokumentów i odchodzenia od komputera, w 3 krokach:

kliknij podaj dane opłać online

Sprawdź, jak to zrobić - Film

Postępowanie: Usługa dotycząca sekwencjonowania oraz bioinformatycznych analiz danych uzyskanych z sekwencjonowania całego eksomu (WES, ang. whole-exome sequencing) dla 100 próbek: 50 pacjentów z ADHD i 50 zdrowych kontroli

Dorota Wiśniewska
Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu Oddział: Dział Obsługi Zakupów
Termin:
Zamieszczenia : 06-04-2020 10:52:00
Składania : 14-04-2020 10:50:00
Otwarcia : -
Tryb:
Rodzaj: Usługa

Wymagania i specyfikacja

Szanowni Państwo. Serdecznie zapraszamy do składania ofert w postępowaniu na SEKWENCJONOWANIE

W trybie 4.d-1-1 PzP zgodnie z regulaminem udzielania zamówień UMP


Zastrzegamy, że postępowanie może zakończyć się brakiem wyboru oferty w przypadku przekroczenia szacowanych środków.


Opis zamówienia:

1. Badanie zgodne z opisem z załącznika - załącznik do umowy -  Opis przedmiotu zamówienia.

2. Planowany termin wykonania - zgodnie z umową.

3. Planowane ilości oznaczeń do wykonania mogą ulec zmianie w ramach zaplanowanej kwoty przeznaczonej na wykonanie badania. Zamawiający nie jest zobowiązany do wykorzystania całej zaplanowanej wartości zamówienia.

4. Termin wykonywania badań może się wydłużyć lub ilość oznaczeń zwiększyć jeśli nie zostanie wykorzystana cała kwota przeznaczona na wykonanie zamówienia.

5. Warunki płatności: 30 dni od otrzymania przez Zamawiającego poprawnie wystawionej faktury.




O udzielenia zamówienia mogą ubiegać się Wykonawcy, którzy spełnią warunki udziału w postępowaniu dotyczące:

Kompetencji lub uprawnień do prowadzenia określonej działalności zawodowej, o ile wynika to z odrębnych przepisów:

Zamawiający uzna warunek za spełniony, jeżeli Wykonawca wraz z ofertą wykaże, że posiada certyfikaty:

 CAP, CLIA, ISO lub EMQ. 


W przypadku pytań:

- formalnych, proszę o kontakt za pośrednictwem przycisku w prawym, dolnym rogu formularza "Wyślij wiadomość" lub pod numerem telefonu: Dorota Wiśniewska tel e-mail: dwisniewska@ump.edu.pl;

- merytorycznych: dr hab. n. med. Dmitrzak-Węglarz Monika mweglarz@ump.edu.pl

- związanych z obsługą platformy, proszę o kontakt z Centrum Wsparcia Klienta platformy zakupowej Open Nexus pod nr 22 101 02 02, czynnym od poniedziałku do piątku w godzinach 7:00 do 17:00.   

Oficjalnym potwierdzeniem chęci realizacji zamówienia przez Zamawiającego jest wysłanie zamówienia.


Zamawiający odrzuci ofertę, jeżeli:

a) treść oferty nie odpowiada treści zapytania ofertowego;

b) oferta został złożona przez Wykonawcę wykluczonego z postępowania,

c) jest nieważna na podstawie przepisów prawa.

Załączniki do postępowania

NAZWA ROZSZERZENIE ROZMIAR (kB) DATA PUBLIKACJI ŹRÓDŁO POBIERZ
Opis zamówienia_21_03_2020 (1).docx docx 16.84 2020-04-06 10:52:00 Postępowanie
Umowa badania do postępowania.docx docx 25.19 2020-04-07 07:50:37 Postępowanie

Komunikaty

2020-04-10 12:31 Dorota Wiśniewska Zamawiający informuje, ze treść umowy zawartej z wykonawcą będzie odpowiadać przedmiotowi zamówienia, w tym w szczególności terminy wykonania, wartość zamówienia.
2020-04-10 09:51 Dorota Wiśniewska W dniu 9.04 firma GENOMED zadała pytanie
1. Czy procedura przekazania dokumentów przetargowych odbywa się w całości elektronicznie z wykorzystaniem platformy zakupowej, tzn. czy nie ma konieczności przesyłania oferty w formie papierowej?

2. Czy wymieniony w pkt. 15 certyfikat EMQ to inne oznaczenie certyfikatu EMQN?

3. Czy Zamawiający dostarczy DNA wyizolowany we własnym zakresie?

4. Prosimy o rozstrzygnięcie niejednoznaczności w informacji dotyczącej wymaganych certyfikatów: w pliku opis zamówienia znajduje się sformułowanie: "np.:" Czy oznacza to, że Wykonawca może przedstawić również inne poza czterem wymienionymi powszechnie uznawane certyfikaty potwierdzające doświadczenie i umiejętność sekwencjonowania?

5. Cutadapt to program do usuwania sekwencji adapterów i filtrowania odczytów a nie do usuwania duplikatów. Czy możemy użyć go do etapu do którego został stworzony?

6. Do usuwania duplikatów bardziej polecany przez twórców pakietu GATK z Broad Institute jest program Picard. Czy możemy go wykorzystać do etapu usuwania duplikatów?

7. Ensembl 92 był wydany w kwietniu 2018, obecnie jest dostępny w wersji 99 od stycznia 2020. Czy można użyć nowszych edycji baz danych niż te wymienione w punkcie 11? W tym celu wystarczyła by zmiana zapisu: "Annotacje wariantów do baz danych:" na "Annotacje wariantów do baz danych nie starszych niż:..."


Zamawiający odpowiada:
1. Oferty przyjmujemy wyłącznie elektronicznie
2. W pkt. 15 literówka - dowolny certyfikat potwierdzający jakość
3. Zamawiający dostarczy DNA wyizolowany we własnym zakresie
4.Jak w pkt. 2
5. Tak
6. Tak
7. Tak. Dotyczy użycia najnowszych dostępnych baz
2020-04-10 08:40 Dorota Wiśniewska dnia 9.04 firma MEDGEN zadała pytanie
Proszę o informację na temat przewidywanego terminu zakończenia realizacji umowy oraz planowanego harmonogramu przesyłania próbek (wszystkie jednocześnie czy też transzami).

Zamawiający odpowiada:
Próbki zostaną przesłane w jednej transzy, niezwłocznie po podpisaniu umowy, czas wykonania badania zgodnie z załącznikiem

2020-04-09 07:45 Dorota Wiśniewska Zgodnie z uwagą firmy MEDGEN data zakończenia terminu składania ofert została przesunięta na wtorek 14.04.2020r., z względu na święto przypadające 13.04.2020r.
2020-04-09 07:41 Dorota Wiśniewska W dniu 7.04 firma CEGAT zadała pytanie:
W punkcie nr 5 jest zapis:
Całkowita ilość danych - minimum 8Gb na próbkę (+/- 10%).
Prosimy o zgodę na złożenie naszej oferty z zapisem:
Całkowita ilość danych - minimum 6Gb na próbkę (+/- 10%).
Ponieważ taka liczba koresponduje z pokryciem 50x coverage dla protokolu Twist Human Core Exome (Twist Bioscience).

Zamawiający odpowiada:
Nie wyrażamy zgody na zmianę zapisu w pkt 5
Pozostaje: Całkowita ilość danych - minimum 8Gb na próbkę (+/- 10%)
2020-04-07 07:53 Dorota Wiśniewska Dnia 6.04.2020 otrzymano pytania od firmy CEGAT GMBH o treści:


1.Paragraf 1 ust 1 jest zapis:
Przedmiotem niniejszej Umowy jest odpłatne świadczenie przez Wykonawcę, na zlecenie Zamawiającego, usług z zakresu sekwencjonowania krążących RNA w surowicy, na potrzeby Zakładu Immunologii Nowotworów.
Prosimy o zmianę na zapis:
Przedmiotem niniejszej Umowy jest odpłatne świadczenie przez Wykonawcę, na zlecenie Zamawiającego, usług z zakresu sekwencjonowania całego eksomu (WES, ang. whole-exome sequencing), na potrzeby Zakładu Immunologii Nowotworów.
2.Paragraf 6 ust 1: prosimy o zgodę na złożenie naszej oferty i na zmianę zapisu o karze z 10% na 1%, ponieważ próbki DNA są przygotowywane przez Zamawiającego. Ich jakość będzie widoczna dopiero po etapach kontroli jakości przeprowadzonych w laboratorium, czyli po poniesieniu kosztów analizy Qubitem oraz Bioanalizatorem. Oferent nie może być karany za ewentualne złe przygotowanie próbek przez Zamawiającego.
3.Para 6 ust 3: prosimy o zmniejszenie kary za opóźnienia z 1% na 0,001% celem równego traktowania obu stron. Prośbe swą motywujemy symetrycznością zapisów umowy. Za nieterminowe płatności możemy naliczać tylko odsetki ustawowe.

Zamawiający odpowiada:
Ad 1. zmieniono par 1 w pliku.
Ad 2 Zamawiający zgadza się
Ad 3 Zamawiający zgadza się

Przedmiot zamówienia

Lp Nazwa Opis i załączniki Ilość
/ Jm
Cena netto / Jm Vat Cena brutto / Jm Waluta Adres dostawy Dołącz
Plik
1 cena wartość za całe badanie zgodnie z opisem 1 szt. - (0)
Kursy walut NBP , EUR: 4.3225 PLN

Kryteria i warunki formalne

Lp Nazwa Waga kryterium Opis i załączniki Twoja propozycja lub komentarz Dołącz Plik
1 Cena 20% Wartość oferty 0,00 PLN netto
0,00 PLN brutto
(0)
2 Wykonanie analiz na aparatach Illumina NovaSeq6000. 40% proszę załączyć potwierdzenie (Zamawiający wymaga załączenia pliku) (0)
3 Pełnomocnictwo określające jego zakres – w przypadku gdy Wykonawcę reprezentuje pełnomocnik. - Proszę załączyć jeśli wymagane (0)
4 Oświadczamy, że: - Posiadamy uprawnienia oraz licencje do wykonywania określonej działalności lub czynności, jeżeli przepisy prawa nakładają obowiązek ich posiadania; b. Dysponujemy odpowiednim potencjałem technicznym oraz osobami zdolnymi do wykonywania umowy; c. Znajdujemy się w sytuacji ekonomicznej i finansowej zapewniającej prawidłowe wykonanie umowy (0)
5 Oświadczamy, że: - Uważamy się za związanych niniejszą ofertą przez okres 30 dni od daty składania ofert. (0)
6 Oświadczamy, że: - W przypadku wyboru naszej oferty zobowiązujemy się do zawarcia umowy w miejscu i terminie wyznaczonym przez Zamawiającego. (0)
7 Certyfikaty 40% Proszę załączyć skany. Certyfikaty potwierdzające doświadczenie i umiejętnosć sekwencjonowania np.: CAP, CLIA, ISO lub EMQ. (Zamawiający wymaga załączenia pliku) (0)
(0)
Odblokuj formularz

Liczba odsłon strony: 562